Cốt truyện Ninja School Online - Trường Ninja Ko-ninjustu Hirosaki là trường đạo tạo Nhẫn giả từ bậc thiếu niên. Các môn sinh được phát triển bản thân dựa trên 5 yếu tố: Sức mạnh, Tốc độ, Khả biến, Nhẫn nại và Cân bằng.